Významné odborné organizace jejichž je VÚKOZ členem, podílí se na jejich činnosti osvětovou, výzkumnou činností nebo s nimi spolupracuje při aplikaci vlastního výzkumu do praxe.
- Agentura ochrany přírody a krajiny České republiky www.nature.cz
- Česká informační agentura životního prostředí (CENIA) www.cenia.cz
- Česká geologická služba www.geology.cz
- Česká inspekce životního prostředí www.cizp.cz
- Český hydrometeorologický ústav portal.chmi.cz
- Správa jeskyní České republiky www.jeskynecr.cz
- Správa Krkonošského národního parku www.krnap.cz
- Správa Národního parku a chráněné krajinné oblasti Šumava www.npsumava.cz
- Správa Národního parku České Švýcarsko www.npcs.cz
- Správa Národního parku Podyjí www.nppodyji.cz
- Státní fond životního prostředí České republiky www.sfzp.cz
- Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka www.vuv.cz
- Výzkumný ústav Silva Taroucy pro krajinu a okrasné zahradnictví, v.v.i. www.vukoz.cz
